Uiteraard zijn er ook een aantal nadelen aan Social Impact Bonds (SIBs) waar rekening mee gehouden moet worden:
- De maatschappelijke vraagstukken die met een SIB worden aangegaan zijn ingewikkeld. Het is daarom van belang dat er vooraf een goede haalbaarheidsstudie wordt gedaan.
- Een SIB opzetten kan veel tijd kosten en duur zijn. Dit betekent dat in de meeste gevallen alleen grote deals kosteneffectief kunnen worden gemaakt. Een mogelijke oplossingen hiervoor is een resultatenfonds waarbij er één raamwerk wordt gecreëerd voor meerdere deals.
- Het gevaar van cherry picking ligt op de loer, waarbij alleen deelnemers worden geselecteerd waarmee eenvoudig resultaten behaald kunnen worden. Om dit te voorkomen is het van belang dat er een goede selectieprocedure is ingericht en er goed wordt gemeten.

